DB6523T 408-2024 羊基因组选择育种技术规程

《DB6523T 408-2024羊基因组选择育种技术规程》是新疆维吾尔自治区发布的关于羊基因组选择育种的技术规范。以下是对该标准中一些重要条文的详细解读：

一、适用范围

本标准适用于采用基因组选择技术进行羊品种改良和选育的工作，包括但不限于绵羊和山羊品种。

二、术语和定义

1. 基因组选择：利用高密度SNP芯片或全基因组重测序数据对个体进行基因型测定，并基于这些数据预测个体的育种值。

2. 育种值：指个体在特定性状上的遗传潜力，通常以估计育种值（EBV）表示。

三、采样与DNA提取

1. 样品采集：应从耳缘组织、血液或其他适宜部位采集样本。确保样品的新鲜度和无污染。

2. DNA提取：使用商业化试剂盒按照说明书操作，保证DNA的质量和浓度达到后续实验的要求。

四、基因分型

1. 使用高通量SNP芯片或者高通量测序技术获取基因型信息。

2. 数据质控：剔除低质量标记、偏离 Hardy-Weinberg 平衡的标记以及缺失率高的个体。

五、数据分析

1. 群体结构分析：通过主成分分析（PCA）或结构分析软件（如STRUCTURE）评估群体间的遗传关系。

2. 遗传参数估计：计算群体的等位基因频率、杂合度、多态性信息含量（PIC）等指标。

3. 育种值预测：应用BLUP-F90、Gibbs sampler等方法构建模型，预测个体的育种值。

六、结果应用

1. 在育种计划中优先考虑具有较高育种值的个体作为种公羊或种母羊。

2. 定期更新参考群体，保持模型的有效性和准确性。

七、档案管理

建立完整的档案记录，包括但不限于个体基本信息、采样记录、检测报告等，以便追溯和验证。

以上内容涵盖了该标准的核心部分，实际应用时还需结合具体情况进行调整和完善。希望这些解读能够帮助您更好地理解和执行这一技术规程。