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摘要:本文件规定了猪德尔塔冠状病毒和猪流行性腹泻病毒双重荧光RT-PCR检测方法的原理、试剂与材料、仪器设备、样品处理、核酸提取、扩增反应、结果分析及注意事项。本文件适用于猪德尔塔冠状病毒和猪流行性腹泻病毒的实验室检测和诊断。
Title:Dual Fluorescence RT-PCR Detection Method for Porcine Deltacoronavirus and Porcine Epidemic Diarrhea Virus
中国标准分类号:B 46
国际标准分类号:07.100.99
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拓展解读
DB33/T 2405-2021是一项关于猪德尔塔冠状病毒(PDCoV)和猪流行性腹泻病毒(PEDV)双重荧光RT-PCR检测方法的地方标准。该标准适用于从病料中快速检测这两种病毒,为防控猪群的腹泻疾病提供技术支持。
关键条款解读如下:
1. 样品采集:标准要求采集病猪的肠道样本,包括空肠、回肠或十二指肠等部位的新鲜组织。样品应立即置于无RNA酶的保存液中并迅速送检,确保样本的新鲜度和完整性。
2. 核酸提取:采用商业化试剂盒提取总RNA,需严格遵守操作规程以避免RNA降解。提取后的RNA浓度和纯度需通过紫外分光光度计测定,确保后续实验的质量。
3. 引物与探针设计:针对PDCoV和PEDV分别设计特异性引物和荧光探针。引物长度一般在18-25个碱基之间,GC含量控制在40%-60%范围内,熔解温度(Tm)应在55-65℃之间。探针应标记荧光报告基团和淬灭基团,并保持良好的特异性和灵敏度。
4. 反应体系建立:反应总体积通常为20μL,包含逆转录酶、Taq DNA聚合酶、缓冲液、dNTPs、引物、探针以及模板RNA。各成分浓度需经过优化,以获得最佳扩增效果。
5. 扩增条件设定:逆转录步骤温度一般设置为50℃持续15分钟;预变性95℃持续10分钟;随后进行40个循环的两步法扩增,即95℃变性15秒,60℃退火延伸1分钟。
6. 结果判定:Ct值小于阈值判定为阳性,大于阈值且扩增曲线无明显上升趋势判定为阴性。当Ct值处于临界范围时需重复试验验证结果。
7. 质量控制:每批次检测需设立阳性对照、阴性对照及空白对照,确保实验结果准确可靠。同时定期对仪器设备进行校准维护,保证检测系统的稳定性。
8. 安全防护:实验过程中必须严格遵守生物安全规范,使用一次性耗材防止交叉污染,废弃物需按相关规定妥善处理。
该标准通过规范化的操作流程和技术参数,提高了PDCoV和PEDV的检测效率和准确性,对于保障生猪健康具有重要意义。