资源简介
摘要:本文件规定了新型冠状病毒全基因组高通量测序检测的样本要求、实验操作步骤、数据分析及结果报告等内容。本文件适用于医疗卫生机构和第三方检测机构开展新型冠状病毒全基因组高通量测序检测工作。
Title:Technical Specification for Novel Coronavirus Testing - Part 11: Whole Genome High-throughput Sequencing
中国标准分类号:C46
国际标准分类号:11.020
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拓展解读
DB32/T 3762.11—2020《新型冠状病毒检测技术规范 第11部分:全基因组高通量测序》是江苏省发布的关于新冠病毒检测的技术标准。以下将选取一些重要条文进行详细解读。
样本采集与处理
根据标准中的4.1条款,样本采集应遵循无菌操作原则,使用专用的采样工具。采集的样本类型包括鼻咽拭子、口咽拭子等。在样本处理环节(4.2),要求样本应在采集后尽快运输至实验室,并在低温条件下保存。样本处理过程中需注意避免污染,确保样本的完整性和代表性。
实验室准备
标准中强调了实验室环境控制的重要性(5.1)。实验室应当具备独立的空间,配备必要的生物安全设备如生物安全柜。对于实验人员的要求也十分严格,所有参与实验的操作人员都必须经过专业培训并取得相应资质证书,同时要穿戴适当的个人防护装备。
测序流程
在测序前准备阶段(6.1),需要对仪器设备进行全面校准和维护,确保其处于最佳工作状态。样本核酸提取采用自动化或半自动化设备完成(6.2),以提高效率并减少人为误差。文库构建时(6.3)应严格按照试剂盒说明书执行,保证文库质量符合后续测序需求。
数据分析
数据分析部分(7.1)指出,原始数据需经过初步过滤去除低质量序列后才能用于下游分析。比对参考基因组时推荐使用最新的SARS-CoV-2参考序列作为模板。变异位点鉴定过程中,建议结合多个算法预测结果来确认最终结论。此外,还需对整个数据分析过程进行记录存档以便追溯。
质量控制
为了保证检测结果准确可靠,标准特别设置了严格的质量控制措施(8.1)。每次实验都必须设立阳性对照、阴性对照以及空白对照。当检测到阳性信号时,还应该重复检测以验证结果的真实性。对于发现异常情况时,应及时查找原因并采取相应纠正措施。
以上是对DB32/T 3762.11—2020中部分内容的简要解读,旨在帮助相关人员更好地理解和应用该标准开展相关工作。