资源简介
摘要:本文件规定了甘蓝型杂交油菜品种纯度检验的ISSR(Inter-Simple Sequence Repeat)分析方法,包括样品准备、DNA提取、PCR扩增、电泳检测及结果分析等内容。本文件适用于甘蓝型杂交油菜种子生产中的品种纯度鉴定及相关研究工作。
Title:Operational Procedures for ISSR-Based Purity Testing of Brassica napus Hybrid Rapeseed Varieties
中国标准分类号:B 31
国际标准分类号:65.020
封面预览
拓展解读
DB63/T 1159-2012《甘蓝型杂交油菜品种纯度检验 ISSR操作规程》是一项青海省地方标准,用于指导通过ISSR(Inter-Simple Sequence Repeat)技术对甘蓝型杂交油菜品种的纯度进行检测。以下是对该标准中一些重要条文的详细解读:
样品采集与处理
标准指出样品应从目标种植区域随机抽取具有代表性的植株样本,每份样品至少包含50株个体。这是为了确保检测结果能够准确反映整个群体的状态。同时要求在采样过程中避免机械损伤,并尽快将样品送至实验室进行处理。
DNA提取
DNA质量直接影响到后续实验的成功与否。标准强调使用高纯度试剂盒提取高质量的基因组DNA,并且在提取前需要对叶片样本进行适当的预处理如液氮冷冻研磨等方法来保证细胞破裂完全。此外还规定了最低浓度要求以保证扩增效果良好。
引物设计与筛选
引物的设计至关重要,直接影响到特异性扩增效率。标准建议根据ISSR通用引物序列选择适合本研究目的的引物组合,并且通过预试验确定最佳退火温度及反应体系条件。对于新开发的引物则需经过严格的筛选过程,包括但不限于单一性、重复性和稳定性等方面考量。
PCR扩增条件
PCR扩增是整个流程中的核心步骤之一。标准给出了推荐的循环参数:初始变性94℃ 5分钟;接下来35个循环为94℃ 45秒,50-60℃(依据具体引物调整)30秒,72℃ 1分钟;最后延伸阶段72℃ 10分钟。这些参数适用于大多数情况下的扩增需求,但实际操作时还需结合具体情况灵活调整。
胶电泳分析
扩增产物需经琼脂糖凝胶电泳分离后观察。标准推荐使用1.5%-2%的琼脂糖凝胶,在0.5×TBE缓冲液条件下进行电泳。电压设置通常为80V左右,时间为2小时左右。通过观察带型差异来判断不同品种间的遗传关系以及是否存在混杂现象。
数据记录与统计分析
所有观察到的结果都应当详细记录下来,包括但不限于条带的数量、大小范围等信息。然后利用专业软件对数据进行处理和分析,计算出每个样本之间的相似系数矩阵。基于此矩阵可以绘制出聚类图谱,从而进一步确认各供试材料之间的亲缘关系。
以上就是关于DB63/T 1159-2012标准中几个关键环节的具体解读。希望对你有所帮助!