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摘要:本文件规定了两系杂交水稻品种纯度的SSR检测方法,包括术语和定义、原理、样品采集与处理、DNA提取、PCR扩增、电泳分析及结果判定等内容。本文件适用于两系杂交水稻种子品种纯度的检测与鉴定。
Title:Detection Method of Purity for Two-line Hybrid Rice Varieties by SSR
中国标准分类号:B 04
国际标准分类号:65.020
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拓展解读
DB42/T 800-2012《两系杂交水稻品种纯度SSR检测方法》是湖北省地方标准,规定了利用简单重复序列标记(SSR)技术检测两系杂交水稻品种纯度的方法。以下对标准中一些重要条文进行详细解读:
【术语和定义】
标准首先明确了关键术语:
- SSR标记:即简单重复序列标记,是一种基于DNA片段长度多态性的分子标记技术。
- 品种纯度:指供试样品中目标品种种子占总种子数的百分比。
【试剂与材料】
在试剂准备方面,标准要求使用经过验证的特异性引物对,并强调引物设计应覆盖目标品种的关键基因组区域。此外,还规定了PCR反应体系中各种成分的浓度要求,如Mg2+、dNTPs等,确保扩增产物具有良好的特异性和稳定性。
【仪器设备】
标准列出了必要的实验设备,包括荧光定量PCR仪、电泳系统等。特别指出PCR仪需具备温度梯度功能,以便优化反应条件。
【样品制备】
样品制备环节详细描述了如何从种子中提取高质量的基因组DNA。具体步骤包括种子浸泡、胚芽分离、DNA提取及纯化等。每一步骤都附有操作要点,例如浸泡时间建议为12小时,以保证胚芽充分吸水而不损伤。
【检测步骤】
检测步骤部分是整个标准的核心内容。首先确定了SSR标记的选择原则,要求标记具有高多态性且能区分目标品种与其他近似品种。接着详细说明了PCR反应条件设置,包括预变性温度、退火温度、延伸时间等参数的选择依据。最后阐述了电泳分析的具体流程,包括凝胶配制、上样、电泳电压与时间控制等。
【结果判定】
结果判定部分提供了具体的判断标准。当供试样品与目标品种在所有检测位点上的等位基因均一致时,可判定为纯正品种;若出现一个或多个位点不匹配,则需进一步验证。此外,对于存在争议的情况,推荐采用其他分子标记技术进行补充鉴定。
【注意事项】
最后,标准给出了若干操作注意事项。比如强调每次实验应设立阳性对照和阴性对照;提醒操作人员注意防止污染;建议定期校准仪器设备以确保数据准确性。
以上是对DB42/T 800-2012标准中重要内容的深入解读,希望对从事相关工作的技术人员有所帮助。