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摘要:本文件规定了软枣猕猴桃品种鉴别的SSR分子标记法的术语和定义、试验材料要求、DNA提取、PCR扩增、电泳检测及数据分析等内容。本文件适用于软枣猕猴桃品种的鉴定及相关研究工作。
Title:Technical Regulations for Identification of Kiwiberry Varieties by SSR Molecular Markers Method
中国标准分类号:B 61
国际标准分类号:65.020
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拓展解读
DB21/T 3559-2021《软枣猕猴桃品种鉴别技术规程 SSR分子标记法》是一项辽宁省地方标准,为软枣猕猴桃品种的分子鉴定提供了科学依据。以下是该标准中几个关键条款的详细解读:
样品采集与DNA提取
标准要求选择健康、无病害的新梢作为样本,确保样本具有代表性。在DNA提取过程中,应使用高质量的试剂盒,并严格按照操作步骤执行,以保证DNA的质量和纯度。这一步骤对于后续PCR扩增至关重要,直接影响到检测结果的准确性。
引物设计与筛选
根据软枣猕猴桃品种的特点,设计特异性引物时需考虑种间差异性及遗传稳定性。通过预实验筛选出能够稳定扩增且具有明显差异性的引物组合,这是确保SSR标记有效性的基础。标准强调了引物序列长度、GC含量以及退火温度等因素对扩增效果的影响。
PCR反应体系建立
建立优化后的PCR反应体系是获得清晰可靠图谱的关键环节。此部分规定了模板DNA浓度、dNTPs、Mg²⁺离子浓度等参数的最佳范围,并指出不同成分的比例调整需基于具体实验条件反复验证。此外还提到反应体积通常为20μL左右,并建议采用梯度PCR仪寻找最适退火温度。
数据分析与结果判定
数据处理时首先利用专业软件读取电泳图像,记录每个位点上的等位基因数目及其大小。接着比较目标品种与其他已知品种间的相似系数或距离矩阵,以此来判断两者是否属于同一类别。当相似度低于某一阈值(如75%)时,则可认为存在显著区别,从而实现准确的品种鉴别。
注意事项
在实际应用中还需注意避免污染源引入导致假阳性现象发生;同时由于环境因素可能会影响某些微卫星座位的表现型特征,因此在长期监测过程中应当定期更新数据库并重新校准相关指标。另外,对于一些罕见或新发现的突变类型,应及时补充进现有的鉴定体系内,以保持其时效性和实用性。