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摘要:本文件规定了细菌耐药基因blaNDM常见亚型的环介导等温扩增(LAMP)检测技术的原理、试剂与材料、仪器设备、操作步骤、结果判定及注意事项。本文件适用于临床、环境及食品中细菌耐药基因blaNDM常见亚型的快速检测。
Title:Detection Technology of Loop-mediated Isothermal Amplification (LAMP) for Common Subtypes of Bacterial Drug Resistance Gene blaNDM
中国标准分类号:B10
国际标准分类号:11.020
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拓展解读
《DB37/T 3997—2020细菌耐药基因blaNDM常见亚型的环介导等温扩增检测技术》是一项地方标准,该标准规定了利用环介导等温扩增(LAMP)技术检测细菌耐药基因blaNDM常见亚型的方法。以下是对标准中一些关键条款的详细解读。
范围与术语
标准适用于临床样本中细菌耐药基因blaNDM常见亚型的快速检测。其中术语“环介导等温扩增”是指在恒定温度下使用特异性引物对目标DNA片段进行高效扩增的技术。这一技术无需复杂的仪器设备,适合于基层医疗机构使用。
原理
LAMP技术通过设计针对靶序列不同区域的六条特异性引物,在等温条件下实现对目标基因的特异性扩增。标准指出,blaNDM基因具有高度保守性,因此选用其保守区作为扩增靶点,确保检测结果的准确性。
样品采集与处理
样品应从患者感染部位采集,如血液、尿液或伤口分泌物等。样品处理时需注意无菌操作,避免污染。样品处理后需立即进行DNA提取,推荐使用商品化试剂盒以保证提取效率和纯度。
DNA提取
DNA提取是影响检测灵敏度的关键步骤。标准建议采用磁珠法或其他高效提取方法,确保提取出的DNA浓度不低于10ng/μl,并且A260/A280比值应在1.8-2.0之间。
LAMP反应体系建立
LAMP反应体系包括模板DNA、Bst DNA聚合酶、特异性引物、dNTPs以及反应缓冲液。标准要求每个反应体系的总体积为25μl,其中模板DNA量控制在0.5-1.0μl之间。引物的设计需覆盖靶序列的不同区域,以提高扩增特异性。
扩增条件
LAMP扩增通常在60-65℃条件下进行,时间为40-60分钟。标准强调,扩增结束后需立即终止反应,防止非特异性扩增产物的影响。扩增产物可通过肉眼观察或荧光检测仪检测。
结果判定
阳性结果表现为扩增管内液体颜色变化或荧光信号出现,而阴性对照则保持不变。标准特别指出,若出现非特异性扩增,则需重新设计引物并重复实验。
注意事项
标准提醒操作人员在实验过程中严格遵守无菌操作规程,避免交叉污染。同时,定期校准仪器设备,确保检测结果的可靠性。
通过以上解读可以看出,《DB37/T 3997—2020》为临床实验室提供了科学规范的操作指南,有助于提高细菌耐药基因blaNDM常见亚型的检测水平。